MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 58899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018641	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018641	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018641	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
5	NC_018641	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	409995666
6	NC_018641	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	409995666
7	NC_018641	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409995666
8	NC_018641	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	409995666
9	NC_018641	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
10	NC_018641	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995666
11	NC_018641	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995666
12	NC_018641	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	409995666
13	NC_018641	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995666
14	NC_018641	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995666
15	NC_018641	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995666
16	NC_018641	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	409995666
17	NC_018641	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995666
18	NC_018641	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
19	NC_018641	T	6	6	732	737	0 %	100 %	0 %	0 %	409995666
20	NC_018641	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	409995666
21	NC_018641	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
22	NC_018641	T	6	6	765	770	0 %	100 %	0 %	0 %	409995666
23	NC_018641	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	409995666
24	NC_018641	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	409995666
25	NC_018641	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995666
26	NC_018641	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	409995666
27	NC_018641	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	409995666
28	NC_018641	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
29	NC_018641	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	409995666
30	NC_018641	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	409995666
31	NC_018641	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995666
32	NC_018641	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	409995666
33	NC_018641	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
34	NC_018641	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018641	CTATTA	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018641	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018641	AGG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018641	ATG	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995667
39	NC_018641	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
40	NC_018641	CAACG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	20 %	40 %	409995667
41	NC_018641	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995667
42	NC_018641	TCA	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
43	NC_018641	CAT	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
44	NC_018641	A	6	6	2256	2261	100 %	0 %	0 %	0 %	409995667
45	NC_018641	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
46	NC_018641	GAA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995667
47	NC_018641	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
48	NC_018641	GCG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995667
49	NC_018641	AGA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995667
50	NC_018641	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
51	NC_018641	CAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018641	A	6	6	2771	2776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018641	AG	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018641	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018641	T	6	6	2808	2813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018641	ATA	3	9	2861	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995668
57	NC_018641	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	409995668
58	NC_018641	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995668
59	NC_018641	TAG	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995668
60	NC_018641	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_018641	AT	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018641	ATA	3	9	3077	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018641	AT	3	6	3094	3099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018641	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018641	AAAAGT	2	12	3348	3359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018641	AGT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018641	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018641	GAC	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018641	ACA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995669
70	NC_018641	T	6	6	3619	3624	0 %	100 %	0 %	0 %	409995669
71	NC_018641	GAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409995669
72	NC_018641	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995669
73	NC_018641	GGCC	2	8	3772	3779	0 %	0 %	50 %	50 %	409995669
74	NC_018641	TGC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995670
75	NC_018641	ACA	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
76	NC_018641	AATC	2	8	3923	3930	50 %	25 %	0 %	25 %	409995670
77	NC_018641	TCA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
78	NC_018641	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
79	NC_018641	CT	3	6	4111	4116	0 %	50 %	0 %	50 %	409995670
80	NC_018641	GCG	2	6	4191	4196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995670
81	NC_018641	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
82	NC_018641	AGC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
83	NC_018641	ATC	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
84	NC_018641	TGAC	2	8	4343	4350	25 %	25 %	25 %	25 %	409995670
85	NC_018641	GC	4	8	4384	4391	0 %	0 %	50 %	50 %	409995670
86	NC_018641	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
87	NC_018641	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995670
88	NC_018641	AGC	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
89	NC_018641	GC	3	6	4558	4563	0 %	0 %	50 %	50 %	409995670
90	NC_018641	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995670
91	NC_018641	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
92	NC_018641	CAA	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
93	NC_018641	CAC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995670
94	NC_018641	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
95	NC_018641	ACC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995670
96	NC_018641	ATC	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
97	NC_018641	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995670
98	NC_018641	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018641	AGG	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018641	AAGA	2	8	5055	5062	75 %	0 %	25 %	0 %	409995671
101	NC_018641	GAAGA	2	10	5070	5079	60 %	0 %	40 %	0 %	409995671
102	NC_018641	GGC	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
103	NC_018641	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
104	NC_018641	CCAG	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	409995671
105	NC_018641	AGC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995671
106	NC_018641	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995671
107	NC_018641	TGA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
108	NC_018641	GCTG	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	409995671
109	NC_018641	TTGAAG	2	12	5260	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
110	NC_018641	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995671
111	NC_018641	GGT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
112	NC_018641	CGG	4	12	5396	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
113	NC_018641	GTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
114	NC_018641	TAC	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995671
115	NC_018641	GGCAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	409995671
116	NC_018641	GAT	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
117	NC_018641	ACC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995671
118	NC_018641	GC	3	6	5714	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	409995671
119	NC_018641	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
120	NC_018641	A	6	6	5790	5795	100 %	0 %	0 %	0 %	409995671
121	NC_018641	GACAA	2	10	5830	5839	60 %	0 %	20 %	20 %	409995671
122	NC_018641	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995671
123	NC_018641	CAA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
124	NC_018641	GGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
125	NC_018641	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
126	NC_018641	GAT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
127	NC_018641	CGG	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
128	NC_018641	GGT	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
129	NC_018641	GGC	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
130	NC_018641	CCTG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	25 %	50 %	409995671
131	NC_018641	ACA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
132	NC_018641	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409995671
133	NC_018641	TCG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995671
134	NC_018641	TGG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
135	NC_018641	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995671
136	NC_018641	CCGATG	2	12	6583	6594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409995671
137	NC_018641	TTG	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995671
138	NC_018641	GCC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409995671
139	NC_018641	AT	3	6	6725	6730	50 %	50 %	0 %	0 %	409995671
140	NC_018641	GAA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995671
141	NC_018641	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409995671
142	NC_018641	GAC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995671
143	NC_018641	TGTT	2	8	6976	6983	0 %	75 %	25 %	0 %	409995671
144	NC_018641	AAC	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
145	NC_018641	GAG	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018641	GAT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
147	NC_018641	CGG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995672
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149	NC_018641	AAG	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995672
150	NC_018641	TTG	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
151	NC_018641	TGC	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995672
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153	NC_018641	GATT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	25 %	0 %	409995672
154	NC_018641	ATG	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
155	NC_018641	GTT	2	6	7540	7545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
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157	NC_018641	CGGT	2	8	7595	7602	0 %	25 %	50 %	25 %	409995672
158	NC_018641	GAC	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
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161	NC_018641	AT	3	6	7863	7868	50 %	50 %	0 %	0 %	409995672
162	NC_018641	GAAAA	2	10	7915	7924	80 %	0 %	20 %	0 %	409995672
163	NC_018641	TGG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995672
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181	NC_018641	ATG	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
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195	NC_018641	TTTG	2	8	9774	9781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018641	GC	3	6	9825	9830	0 %	0 %	50 %	50 %	409995673
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226	NC_018641	ATC	2	6	11271	11276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995675
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232	NC_018641	T	6	6	11545	11550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_018641	CAA	2	6	12257	12262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995677
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251	NC_018641	TTG	2	6	12344	12349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995677
252	NC_018641	TCT	2	6	12460	12465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409995677
253	NC_018641	AGA	2	6	12478	12483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995677
254	NC_018641	AAGA	2	8	12486	12493	75 %	0 %	25 %	0 %	409995677
255	NC_018641	A	7	7	12497	12503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_018641	T	6	6	12535	12540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_018641	ATT	2	6	12541	12546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018641	A	6	6	12551	12556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_018641	AGA	2	6	12611	12616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_018641	ATTA	2	8	12657	12664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_018641	GAA	2	6	12680	12685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_018641	TAG	2	6	12744	12749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_018641	TA	3	6	12818	12823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_018641	TAA	2	6	12825	12830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_018641	TGT	2	6	12840	12845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_018641	GGA	2	6	12873	12878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_018641	AAT	2	6	12897	12902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995678
268	NC_018641	AAG	3	9	12906	12914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995678
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384	NC_018641	AAAG	2	8	18593	18600	75 %	0 %	25 %	0 %	409995683
385	NC_018641	A	7	7	18615	18621	100 %	0 %	0 %	0 %	409995683
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392	NC_018641	A	6	6	18906	18911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_018641	A	6	6	18932	18937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_018641	CAT	2	6	18944	18949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_018641	TTG	2	6	18950	18955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_018641	AAC	2	6	19078	19083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_018641	ATT	2	6	20405	20410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409995686
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